非法行医是一种严重危害公众健康和安全的行为，对于发现的非法行医线索，应当遵循一系列严谨的处理流程。以下是对非法行医巡查发现线索后应如何处理的详细解答：
一、初步核实与调查
线索收集：首先，通过多渠道收集非法行医的线索，包括但不限于群众举报、日常巡查、媒体曝光等。
实地核查：接到线索后，卫生健康行政部门会迅速派遣卫生执法人员前往现场进行实地核查。执法人员会检查该场所是否具备《医疗机构执业许可证》或《诊所备案凭证》，询问相关人员情况，并收集证据材料，如诊疗记录、药品和医疗器械等。
二、立即制止与取证
制止非法行为：一旦发现非法行医行为，执法人员会立即责令行为人停止一切非法执业活动，防止危害进一步扩大。
详细取证：对现场进行详细的拍照、录像，并制作询问笔录，确保有足够的证据来支持后续的处理工作。
三、行政处罚
没收与罚款：根据相关法律法规，卫生健康行政部门会没收行为人在非法行医过程中获取的所有非法所得，以及用于非法行医的药品、医疗器械和其他相关物品。同时，根据情节轻重，对行为人处以违法所得五倍以上二十倍以下的罚款；违法所得不足一万元的，按一万元计算。
其他处罚措施：对于伪造、变造、买卖、出租、出借医疗机构执业许可证的，除了没收违法所得和罚款外，情节严重的还会吊销其医疗机构执业许可证。
四、移送司法处理
刑事追诉：如果非法行医行为涉嫌触犯刑法，如造成严重后果或严重损害就诊人身体健康，卫生健康行政部门会在完成初步调查后，将案件及相关证据材料移交给公安机关或检察机关进一步侦查。
刑事责任：一旦构成非法行医罪，行为人将面临严厉的刑事处罚，包括有期徒刑、拘役、管制以及罚金等。
五、宣传与教育
加强宣传：通过媒体、社区活动等多种方式加强对非法行医危害的宣传，提高公众的自我保护意识。
普及法律知识：向公众普及相关法律法规知识，鼓励大家积极举报非法行医行为，共同维护医疗服务市场的健康发展。
综上所述，对于非法行医巡查发现的线索，应依法依规进行核实、调查、制止、取证、处罚和移送司法处理等一系列工作，以确保公众的健康和安全得到有力保障。同时，加强宣传和教育也是预防非法行医行为的重要手段。