非法行医过程中发现的药品应当被依法没收。具体分析如下：

一. 非法行医中药品的处理

1. 没收非法药品：根据相关法律法规，对于非法行医行为，卫生行政部门在查处过程中会一并收缴用于非法行医的药品。这是为了防止这些药品继续被用于非法活动，从而保障公众的健康安全。
2. 后续处理：被没收的药品通常会被相关部门进行进一步的处理，如销毁或按照相关规定进行妥善处置，以确保其不会再次流入市场或被非法使用。

二. 法律依据

• 《医疗机构管理条例》及相关法律法规规定，对于非法行医行为，卫生行政部门有权进行查处，并没收非法所得和药品、器械等。

三. 实际案例理解

• 例如，某非法行医者在被查处时，其用于非法行医的药品被卫生行政部门依法没收，并进行了后续的处理，以确保这些药品不会再次被用于非法活动。

我建议，对于非法行医行为，公众应积极向相关部门举报，以维护医疗市场的秩序和公众的健康安全。同时，对于发现的非法药品，也应由相关部门依法进行处理，防止其继续危害社会。如有进一步需要，您可以继续咨询我。