司机用公务卡私自加油后主动退款，其行为仍可能构成贪污违法行为，但退款行为可作为量纪量刑时的情节予以考虑。

一. 行为性质分析

1. 贪污违法行为的认定：司机使用公务卡私自为私车加油，这一行为侵害了公共财物的所有权，从法律上定义，属于侵吞公共财物的贪污行为。即使后续主动退款，也不能改变其行为的违法性。
2. 退款行为的影响：虽然退款不能消除行为的违法性，但可以作为量纪量刑时的一个情节予以考虑。退款表明司机有一定的悔过意识，可能在处罚时会得到一定的从轻或减轻处理。

二. 处理建议

1. 立案调查：根据《监察法》的相关规定，对于司机的贪污违法行为，监察机关可以立案调查。
2. 政务处分：调查结束后，根据司机的违法事实和情节，结合其退款行为，给予相应的政务处分。
3. 教育引导：除了法律处罚外，还应加强对司机的教育引导，增强其纪律意识和法治观念，防止类似行为再次发生。

• 例如，某单位司机私自使用公务卡为私车加油，后被单位发现。虽然该司机主动退款，但单位仍按照相关规定对其进行了政务处分，并加强了对其的教育和管理。

综上所述，司机用公务卡私自加油后主动退款，其行为仍构成贪污违法行为，但退款行为可作为量纪量刑时的情节予以考虑。我建议单位或监察机关在依法处理的同时，也应加强教育引导，防止类似行为再次发生。如有进一步需要，您可以继续咨询我。