针对您提出的“货物运输合同纠纷起诉后要求的货款扣除欠对方的应该支持吗”这一问题，我将从法律角度进行详细分析。

核心结论：在货物运输合同纠纷中，是否支持货款扣除欠对方的款项，主要取决于合同的具体条款、双方的约定、相关法律法规以及违约行为的性质和后果。

详细分析：

1. 合同具体条款与双方约定：

   • 如果双方在运输合同中已就货款扣除或相关费用的处理进行了明确规定，如某种情况下可以扣除货款以抵偿欠款等，则应严格按照合同约定处理。
   • 若合同中没有关于货款扣除的明确约定，则需参考相关法律法规进行裁决。

2. 相关法律法规：

   • 根据《民法典》的相关规定，承运人对运输过程中货物的毁损、灭失承担赔偿责任。若因承运人过错导致货物损坏或灭失，托运人有权拒绝支付运费并要求返还已支付的运费。在此情况下，如果托运人欠承运人其他款项，承运人主张从货款中扣除可能得到支持，但需考虑扣除的合理性及双方过错程度。
   • 同时，《民法典》也规定了托运人在承运人将货物交付收货人前，有权要求中止运输、返还货物等，但需赔偿承运人因此遭受的损失。若托运人欠承运人款项，且该欠款与运输合同直接相关，承运人主张从货款中扣除欠款可能得到支持。

3. 违约行为与货款扣除的合理性：

   • 如果承运人存在违约行为（如未按约定时间、地点运输，或擅自改变运输路线导致延迟等），给托运人造成损失，托运人有权要求减少或不支付运费。在此情况下，承运人主张从货款中扣除欠款可能不予支持。
   • 若托运人存在违约行为（如提供虚假信息、中途变更或解除合同等），导致承运人遭受损失，包括已产生的运费或欠款，承运人有权要求托运人赔偿。此时，承运人主张从货款中扣除欠款可能得到支持。

4. 综合判断：

   • 在处理此类纠纷时，应综合考虑合同的具体条款、双方的履约情况、违约行为的性质和后果以及相关法律法规的规定。
   • 法院或仲裁机构将根据公平原则、诚实信用原则等基本原则，判断货款扣除是否合理及应由哪方承担。

总结：

在货物运输合同纠纷中，货款扣除欠对方的款项是否应得到支持，需根据具体案件情况进行综合分析和判断。建议当事人在处理此类纠纷时，仔细审查合同条款、收集相关证据，并咨询专业律师以获取更准确的法律意见和帮助。如果您有进一步的法律问题或需要具体的法律建议，请随时向我提问。