针对“国企书记不配合总经理工作，董事长应该怎么办”的问题，以下是我的建议：

首先，董事长应明确公司内部的职责分工和权力结构，确保每位高管都清楚自己的职责和权限。在此基础上，针对书记不配合总经理工作的情况，可以从以下几个方面着手处理：

1. 沟通协商：

   • 董事长可以组织一次面对面的会议，邀请书记和总经理共同参加，明确表达对公司内部合作与协调的重视。
   • 在会议上，鼓励双方坦诚地表达各自的观点和立场，寻求共识和解决方案。
   • 强调团队合作的重要性，以及个人行为对公司整体利益的影响。

2. 明确职责与期望：

   • 董事长应与书记和总经理分别谈话，明确各自的职责范围和工作期望。
   • 确保书记理解其作为公司高层领导的责任，以及应如何与总经理协同工作以推动公司发展。
   • 同时，也要了解总经理的困难和需求，为其提供必要的支持和资源。

3. 制定合作机制：

   • 设立定期的沟通会议或工作协调机制，以便书记和总经理能够及时交流工作进展和遇到的问题。
   • 制定明确的工作流程和决策程序，确保双方在工作中的配合更加顺畅和高效。

4. 绩效考核与激励：

   • 将团队合作和协同工作纳入高管绩效考核体系，对表现优秀的个人和团队给予适当的奖励和表彰。
   • 通过绩效考核来引导和激励书记和总经理更加积极地配合工作，共同推动公司目标的实现。

5. 考虑人事调整：

   • 如果经过上述努力后，书记仍然不配合总经理工作，且对公司整体运营产生了负面影响，董事长应考虑进行人事调整。
   • 这可能包括调整书记的职位、职责或甚至解除其职务，以确保公司内部的和谐与稳定。

6. 法律途径：

   • 在极端情况下，如果书记的行为涉嫌违法或严重违反公司章程，董事长可以寻求法律途径来解决问题。
   • 这可能包括向有关部门举报、提起民事诉讼或采取其他法律手段来维护公司的合法权益。

综上所述，董事长在面对国企书记不配合总经理工作的情况时，应通过沟通协商、明确职责与期望、制定合作机制、绩效考核与激励以及考虑人事调整等多种方式来解决问题。同时，也要保持对法律途径的关注和准备，以确保公司内部的和谐与稳定以及公司的合法权益不受侵害。