当然可以申请离职。下面我详细为你解释一下相关的情况和建议：

1. 离职权利：

   • 根据《劳动合同法》，劳动者有权在任何时候提出离职，只要按照法律规定的程序进行即可。你在职期间因与员工发生矛盾被停工作，并不影响你申请离职的权利。

2. 离职程序：

   • 你需要向用人单位提交离职申请，并尽量以书面形式提出，以保留证据。
   • 在离职申请中，你可以简要说明离职的原因，如与同事的矛盾导致工作环境不佳等。
   • 用人单位应当在收到离职申请后的一定时间内（通常是30天）与你办理离职手续。

3. 新工作与离职的关系：

   • 你已经找到了一份新工作，这并不影响你申请离职。实际上，新工作的机会可能正是你决定离职的一个原因。
   • 在办理离职手续时，你需要确保与原用人单位的劳动关系完全解除，以避免后续可能出现的法律纠纷。

4. 法律建议：

   • 在离职过程中，务必保留好所有与离职相关的证据，如离职申请、离职证明、工资结算单等。
   • 如果用人单位在离职过程中存在违法行为，如拒绝办理离职手续、拖欠工资等，你可以向当地劳动监察部门投诉，或者寻求法律援助。

综上所述，你完全有权申请离职，并且新工作的机会并不影响你行使这一权利。在离职过程中，请务必遵循法律程序，并保留好相关证据以维护自己的合法权益。如果你有任何其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。