当企业员工涉及刑事立案并考虑辞职时，这是一个涉及多个法律层面和实际操作步骤的问题。以下是对此问题的详细解答：
一、员工辞职的权利
首先，需要明确的是，即使公司涉及刑事立案，员工仍然有权根据个人情况决定是否辞职。仲裁立案与员工的离职行为是两个独立的法律程序，员工申请劳动仲裁（如果涉及）与其是否在职并无直接关联。员工在离职后一年内，只要符合仲裁时效的规定，仍然有权向劳动仲裁机构提起仲裁申请。
二、立案后辞职对劳动仲裁的影响
立案后辞职对劳动仲裁的影响主要取决于辞职时是否遵循了正规流程以及是否存在违反法律规定的行为。具体来说：
- 如果员工在辞职过程中遵循了公司规定和法律法规，且未对劳动仲裁案件（如果涉及）产生实质性影响，那么其辞职行为通常不会对劳动仲裁结果产生负面影响。
- 如果员工在辞职过程中存在违法行为或未履行应尽义务，如未提前通知、未办理离职手续等，这些行为可能会被用人单位作为抗辩理由，对劳动仲裁结果（如果涉及）产生一定影响。
三、立案后离职的正规流程
为了确保离职过程的顺利进行，员工应遵循以下正规流程：
- 提交书面辞职申请：员工应提前向公司提交书面辞职申请，并说明辞职原因及离职日期。这是确保双方权益的重要步骤。
- 完成交接工作：按照公司规定和劳动合同约定，员工需要完成离职前的各项交接工作，包括工作资料、客户资料、财务账目等。这是保证公司业务连续性和客户利益的重要环节。
- 确保合规性：员工应确保离职过程中未违反公司规定和法律法规，如未泄露公司机密、未损害公司利益等。这是维护个人职业道德和公司利益的基本要求。
- 办理离职手续：员工应与公司相关部门办理离职手续，包括领取离职证明、结算工资和福利等。这是确保双方权益得到妥善处理的必要步骤。
四、特殊情况下的处理
如果员工是因被依法追究刑事责任而考虑辞职或被企业辞退，情况则有所不同。在这种情况下：
- 企业应明确规章制度：在规章制度中明确规定当员工被依法追究刑事责任时，企业可以与其解除劳动合同。此处的刑事责任是指员工被法院判处刑事处罚或者免于刑事处分的情形。
- 固定和收集证据：企业需要固定、收集证据以证明劳动者被依法追究刑事责任，主要的证据为法院的相关判决。
- 与工会沟通：企业需要与工会保持沟通，将辞退员工的情况书面通知工会，并听取工会的意见。如果工会同意用人单位的决定，用人单位可以辞退员工；如果工会有不同意见，用人单位应当研究工会的意见，并将处理结果书面通知工会。
- 制作解除合同通知书：企业需制作解除合同的通知书，并由员工签收。如果员工拒绝签收，则应按照法定程序进行送达和公告。
综上所述，企业员工在涉及刑事立案并考虑辞职时，应充分了解自己的权利和义务，并遵循正规流程进行离职操作。同时，企业也应根据具体情况制定相应的处理措施，确保双方权益得到妥善处理。