借款协议只盖财务章和法人章，在一般情况下是具有法律效力的，但具体效力还需结合协议的其他内容和实际情况来判断。以下是对这一问题的详细分析：

1. 财务章和法人章的法律意义：

   • 财务章通常用于公司财务活动的确认，如收款、付款等，它代表了公司在财务事务上的认可。
   • 法人章则是公司法定代表人的个人印章，用于代表公司签署各类法律文件，具有代表公司意志的法律效力。

2. 借款协议的法律效力：

   • 借款协议本身是一种法律文件，用于明确借贷双方的权利和义务。只要协议内容合法、双方意思表示真实，且符合法律规定的形式要求，即具有法律效力。
   • 在借款协议上加盖财务章和法人章，可以视为公司对该借款行为的认可，并愿意承担由此产生的法律责任。

3. 需要注意的情况：

   • 如果借款协议中明确规定了需要加盖公司公章或其他特定印章才具有法律效力，那么仅盖财务章和法人章可能不足以使协议生效。
   • 如果借款行为涉及大额资金或特殊事项，可能还需要履行公司内部审批流程或取得其他相关部门的同意，否则即使加盖了印章，协议也可能因违反公司内部规定而无效。
   • 此外，如果借款协议存在欺诈、胁迫等违法情形，或者协议内容违反法律、行政法规的强制性规定，那么即使加盖了印章，协议也不具有法律效力。

综上所述，借款协议只盖财务章和法人章在一般情况下是具有法律效力的，但具体效力还需结合协议的其他内容和实际情况来判断。如果您在借款协议方面遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。