税收考核的合法性主要取决于其是否遵循了国家相关的法律法规和政策规定。从您提供的参考信息来看，虽然直接关于税收考核合法性的论述不多，但可以从以下几个方面进行推断和分析：

首先，税收考核通常是政府为了规范税收管理、促进产业发展而采取的一种管理措施。在厦门市自然资源和规划局的答复中，提到了规范工业用地税收监管是引导产业高质量发展、促进土地节约集约利用的重要手段。这表明税收考核在一定程度上是出于政府管理和社会经济发展的需要而设立的。

其次，税收考核的具体实施方式和内容需要符合相关法律法规的规定。例如，税收考核的期限、考核方式、考核标准等都需要有明确的规定，并且这些规定不能违反国家税收法律、法规的基本原则和强制性规定。在厦门市的案例中，政府通过制定《厦门市工业项目建设用地控制标准》等文件，对不同产业类型的税收考核指标进行了明确规定，并且考虑了工业项目的发展周期和市场波动性等因素，对税收考核方式进行了优化。这些做法都体现了政府依法行政、合理行政的原则。

最后，税收考核的合法性还需要考虑其是否侵犯了纳税人的合法权益。政府在进行税收考核时，应当尊重纳税人的合法权益，不得随意增加纳税人的负担或者侵犯纳税人的合法权益。在厦门市的案例中，政府明确提到了要切实减轻工业企业负担，支持企业扩大有效投资等措施，这表明政府在税收考核中注重保护纳税人的合法权益。

综上所述，税收考核在符合相关法律法规规定、尊重纳税人合法权益的前提下，是具有一定合法性的。当然，具体的合法性还需要根据具体的税收考核政策、实施方式以及相关法律法规的规定来进行判断。如果您对具体的税收考核政策有疑问或者担忧，建议咨询专业的法律人士或者相关部门进行了解。