关于企业考核制度的合法性，这主要取决于考核制度的制定与实施是否遵循了相关的法律法规，并且是否符合公平、公正、公开的原则。以下是对此问题的详细解答：
一、法律法规依据
行政检查与考核的合法性基础：
- 根据国务院办公厅印发的《关于严格规范涉企行政检查的意见》，行政检查（包括考核）作为行政执法主体履行行政管理职责的重要方式，必须依法进行，且要求于法有据。这意味着企业考核制度的制定和实施需要有明确的法律依据。
国有企业考核的特殊规定：
- 对于国有企业，如河源市人民政府国有资产监督管理委员会所发布的通知中提到的，完善考核制度是为了加强对市属企业的监管，落实国有资本保值增值责任，并建立有效的激励和约束机制。这类考核制度通常会在国有企业改革深化提升行动的框架下进行，确保其合法性和合规性。
二、考核制度的合法性要素
制定程序的合法性：
- 考核制度的制定应经过合法的程序，如企业内部决策流程、职工代表大会讨论等，确保制度的制定过程公开透明，且符合企业章程和相关法律法规。
内容的合法性：
- 考核制度的内容应合法合规，不得违反国家法律法规的强制性规定。例如，考核标准应明确、合理，不得设置歧视性或不合理的要求；考核结果的应用应公正、公平，不得用于非法目的。
实施过程的合法性：
- 在实施考核制度时，应确保考核过程的公正性和透明度，避免主观臆断和不当干预。同时，应保障被考核者的合法权益，如申诉权、知情权等。
三、合法性保障措施
依法确认检查主体资格：
- 类似于行政检查，企业考核制度的实施主体也应具备相应的资格，并依法进行确认和公告。
动态管理与公开透明：
- 考核事项应实行动态管理，并确保考核标准、考核过程、考核结果等信息的公开透明，以便接受监督。
建立申诉与反馈机制：
- 应建立有效的申诉与反馈机制，允许被考核者对考核结果提出异议，并确保异议得到及时、公正的处理。
四、结论
企业考核制度的合法性取决于其制定与实施是否遵循了相关的法律法规，并且是否符合公平、公正、公开的原则。只要考核制度在制定程序、内容、实施过程等方面都符合法律法规的要求，并且建立了有效的合法性保障措施，那么该考核制度就是合法的。因此，在制定和实施企业考核制度时，应确保其合法性和合规性，以维护企业的稳定发展和员工的合法权益。