协议书一般不可以只认可部分。协议书通常是双方协商一致后达成的全面约定，每一部分都是整体协议的一部分，相互关联、相互制约。如果只认可部分协议，可能会破坏协议的整体性和平衡性，导致协议无法有效执行。
具体来说：
协议的整体性：协议书是一个完整的法律文件，其中的每一个条款都是经过双方讨价还价后确定的，它们共同构成了协议的整体内容。只认可部分条款，无异于对协议进行了单方面修改，这违背了协议的基本原则。
合同的约束力：根据《民法典》的相关规定，依法成立的合同，受法律保护，对当事人具有法律约束力。当事人应当按照约定履行自己的义务，不得擅自变更或者解除合同。因此，只认可部分协议，实际上是在试图变更或解除原合同，这需要双方协商一致，否则可能构成违约。
可能引发的纠纷：如果只认可部分协议，而对方不同意这种部分认可，那么很容易引发新的纠纷。这种纠纷不仅会增加解决争议的成本，还可能破坏双方原有的合作关系。
因此，我建议你在签署协议书之前，务必仔细审查每一个条款，确保自己能够全面接受并履行。如果有任何疑问或不满，应及时与对方沟通协商，以达成全面、有效的协议。如果你已经签署了协议书，但对其中的部分条款有异议，可以寻求法律途径来维护自己的权益，但需要注意的是，这通常需要双方同意或依据法律规定进行。