结论前置：月薪28天制下，周六周日不上班是否会扣工资，主要取决于劳动合同中的约定以及公司的规章制度。如果合同约定或公司规章制度规定周六周日为休息日，则不上班不会扣工资；反之，如果规定周六周日为工作日，则不上班可能会按照公司规定扣发相应工资。
详细分析：
劳动合同约定：
- 劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。
- 如果劳动合同中明确约定了周六周日为休息日，那么劳动者在这两天不上班是符合合同约定的，用人单位不得因此扣发工资。
公司规章制度规定：
- 除了劳动合同外，公司还可能制定有规章制度，对员工的工作时间、休息休假等进行规定。
- 如果公司规章制度中规定周六周日为工作日，而劳动者未上班，那么根据规章制度的规定，用人单位有权扣发相应工资。
特殊情况：
- 如果周六周日恰逢法定节假日或公司统一安排的调休日，那么劳动者在这两天不上班通常也不会被扣工资。
- 另外，如果劳动者因特殊原因（如生病、请假等）无法在周六周日上班，并且按照公司规定提前办理了请假手续，那么用人单位也不应因此扣发工资。
法律建议：
- 劳动者在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于工作时间、休息休假和工资支付等方面的约定。
- 劳动者应了解并遵守公司的规章制度，如有疑问或不明确之处，应及时向公司相关部门咨询。
- 如果劳动者认为用人单位存在无故扣发工资的情况，可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
总之，月薪28天制下周六周日不上班是否会扣工资，需要根据劳动合同和公司规章制度的具体规定来判断。劳动者应了解自己的权益和义务，并在必要时采取合法途径维护自己的权益。