结论前置：是的，停工可以部分停工或个别部门停工。

详细分析：

从法律角度来看，用人单位作为实际经营主体，拥有自主经营权。这意味着，用人单位可以根据自身的经营情况和需求，决定是否停工停产，以及是选择部分停工停产还是全部停工停产。法律并未对此作出具体的限制性规定。

然而，值得注意的是，用人单位在行使这一自主权时，必须遵守相关法律法规，不得滥用权利。具体来说，用人单位不得仅针对个别劳动者作出停工停产的决定，这样的决定不得具有侮辱性和惩罚性，而应当无差别地适用于相关劳动者。否则，用人单位可能会因未提供必要的劳动条件而承担法律责任。

综上所述，停工可以部分停工或个别部门停工，但用人单位在作出这一决定时，必须遵守相关法律法规，确保决定的合法性和合理性。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。