对于政府已经罚过款的违章建筑，其处理方式主要依据建筑的具体情况和相关法律法规来决定。以下是对这一问题的详细解答：
一、已罚过罚金的违章建筑的一般处理原则
在我国，即使违章建筑已经缴纳了罚金，也并不意味着它可以被保留。根据相关法律法规，建筑在建设时应取得土地、规划、城建等部门的审核批准，并获得建筑许可证。一旦发现违章建筑，相关部门会立即采取行动，包括勒令停工等，以确保建筑活动的合法性。
二、具体处理方式
责令补办手续：
- 对于某些违章建筑，如果经过城市土管、规划部门的罚款处理后，责令其补办相关手续，那么建筑所有人需要按照要求补办。在补办完手续后，如果建筑符合规划要求，可能会由违章建筑变为合法建筑。
必须拆除：
- 如果违章建筑在缴纳罚金后仍未补办手续，或者补办手续但不符合规划要求，那么这类建筑通常会被要求拆除。因为它们的存在违反了城市规划，需要被清理以确保城市的有序发展。
特殊情况处理：
- 对于一些特殊情况，如建筑虽然属于违章建筑，但已经按照城市土管、规划部门的处罚并补办了所有手续，且在处罚决定上载明了附加条件的，需要严格按照附加条件执行。如果附加条件要求在城市规划建设时无条件拆除，那么该建筑在需要时就必须被拆除，且不能享受任何拆迁补偿安置待遇。
三、对建筑材料和补偿的考虑
- 对于必须拆除的违章建筑，虽然建筑本身不能保留，但建筑材料通常是建筑所有人的合法收益购置的。因此，在拆除时，相关部门可能会酌情对建筑材料进行补偿，但补偿通常只限于其残存价值，而不是建筑物的实际价值。
四、总结
综上所述，对于政府已经罚过款的违章建筑，其处理方式并不是一成不变的。而是需要根据建筑的具体情况、相关法律法规以及城市规划的要求来综合决定。在处理过程中，既要确保城市的有序发展，也要充分考虑到建筑所有人的合法权益。