职务侵占协商退股不合法。职务侵占属于刑事案件，法律明确规定不能通过协商调解解决。下面我详细为你解释一下：

职务侵占的法律性质

职务侵占罪是指公司、企业或其他单位的人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，且数额较大。这是一种刑事犯罪行为，一旦构成，将受到法律的制裁。

协商退股的合法性分析

1. 刑事案件不可调解：职务侵占作为刑事案件，其处理必须严格遵循法律程序，不能通过简单的协商来解决。即使双方达成了某种协议，也不能免除犯罪嫌疑人的刑事责任。

2. 受害人撤诉的限制：如果受害人选择自行提起诉讼，并在后续过程中申请撤诉，这在某些情况下是可能的。但如果是检察机关代表国家提起的公诉，通常是不能撤回的。

3. 退股与职务侵占的独立性：退股是公司股东之间的一种行为，与职务侵占是两个独立的事项。职务侵占的犯罪行为不能通过退股来掩盖或抵消。

法律建议

1. 面对职务侵占的处理：如果公司发现有人涉嫌职务侵占，应立即向公安机关报案，由公安部门进行调查处理。在证据确凿的情况下，犯罪嫌疑人将面临法律的制裁。

2. 退股的合法性考量：如果股东希望退股，应严格按照公司章程和相关法律法规的规定进行。退股过程中应确保所有手续的合法性和合规性，避免与职务侵占等违法行为混淆。

3. 加强内部管理：公司应建立健全的内部管理制度，加强对员工的教育和培训，提高员工的法律意识和职业道德水平。同时，应加强对公司财物的监管和审计，及时发现并防止职务侵占等违法行为的发生。

综上所述，职务侵占协商退股是不合法的。职务侵占是刑事案件，必须依法处理；而退股应严格按照公司章程和相关法律法规进行。如果你或你所在的公司面临类似问题，建议及时咨询专业律师，以便得到正确的法律指导和帮助。