光伏公司与村民只签电子合作协议是合法的。根据相关法律法规，当事人订立合同可以采用书面形式、口头形式或其他形式。而书面形式并不仅限于传统的纸质合同，它还包括信件、电报、电传、传真以及电子数据交换、电子邮件等能够有形地表现所载内容，并可以随时调取查用的数据电文。因此，电子合同同样具有法律效力。

具体来说，电子合同要具备法律效力，需要满足以下几个条件：

1. 行为人具有相应的民事行为能力：即签订合同的双方都必须具备签订合同所需的法律资格。
2. 意思表示真实：合同内容必须是双方真实意愿的表达，不存在欺诈、胁迫等情形。
3. 不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗：合同内容必须合法，不能违反国家法律法规的强制性规定，也不能违背社会公共道德和秩序。

在光伏公司与村民的合作中，如果双方通过电子形式签订了合作协议，并且该协议满足了上述条件，那么这份电子合同就是具有法律效力的。双方都应该按照合同的约定履行自己的义务，如果发生纠纷，也可以依据这份电子合同来维护自己的合法权益。

总的来说，光伏公司与村民只签电子合作协议是合法的，但前提是这份电子合同必须满足法律规定的效力要件。如果有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。