公司与村经济合作社签订荒山的租赁合同，其实质并不等同于承包经营合同。下面我将从几个方面进行详细解释：

1. 合同性质与目的：

   • 租赁合同：是出租人将租赁物交付承租人使用、收益，承租人支付租金的合同。其目的在于通过支付租金获得对租赁物的使用权。
   • 承包经营合同：通常是在保持企业所有权不变的前提下，按照所有权与经营权相分离的原则，由发包方与承包方签订的，明确双方权利义务关系的协议。其目的在于通过承包经营的方式，实现对企业或资产的经营管理。

2. 合同主体与关系：

   • 租赁合同：主体为出租人和承租人，双方之间是租赁关系，即物权关系的一种。
   • 承包经营合同：主体通常为发包方（如企业所有者）和承包方（如经营者），双方之间是承包关系，往往涉及企业经营权的让渡。

3. 合同内容与条款：

   • 租赁合同：主要条款包括租赁物、租赁期限、租金、租赁物的维修与保养等，侧重于租赁物的使用和管理。
   • 承包经营合同：主要条款包括承包经营的范围、期限、方式、收益分配、风险承担等，侧重于企业整体或某一部分的经营权和管理权。

4. 法律适用与争议解决：

   • 租赁合同：主要适用《民法典》中关于租赁合同的规定，争议解决通常依据合同约定或相关法律规定。
   • 承包经营合同：除了可能适用《民法典》的相关规定外，还可能涉及《公司法》、《农村土地承包法》等特定领域的法律法规，争议解决需考虑更多法律因素。

综上所述，公司与村经济合作社签订的荒山租赁合同，在性质、目的、主体关系、内容条款以及法律适用等方面，均与承包经营合同存在显著差异。因此，其实质并非承包经营合同，而是租赁合同。如有进一步疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询。