养女在生父母墓碑上刻为生父之姓，本人有异议的情况下，该行为不合法。具体分析如下：

一. 养女在生父母墓碑上刻名属于人格权益范畴

1. 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第九百九十条，人格权是民事主体享有的包括姓名权在内的权利，以及基于人身自由、人格尊严产生的其他人格权益。
2. 分析说明：养女在生父母墓碑上刻名，系基于与逝者的身份关系产生，这一行为攸关人格尊严，属于人格权益范畴，依法应予保护。

二. 养女有权决定自己的姓名使用

1. 法律依据：同样依据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事主体有权决定自己的姓名使用，包括在何种场合、以何种方式使用。
2. 分析说明：养女作为独立的民事主体，有权决定是否在生父母墓碑上刻名，以及刻何种姓名。若养女本人有异议，即表示她不同意在墓碑上刻为生父之姓，这一意愿应当得到尊重。

三. 综合判断

1. 结合习俗与法律规定：虽然为逝世亲人立碑刻名是我国传统习俗，但这一习俗的遵循应建立在尊重逝者及近亲属意愿的基础上。养女作为近亲属之一，有权表达自己的意愿，并决定是否在墓碑上刻名及刻何种姓名。
2. 结论：因此，在养女本人有异议的情况下，他人在其生父母墓碑上刻为生父之姓的行为，侵犯了养女的人格权益，是不合法的。

我建议：若养女对此行为表示异议，可与相关人员进行沟通协商，要求停止侵害行为，并可根据实际情况寻求法律援助或提起诉讼以维护自己的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。