外商投资法5年过渡期届满后，未修改公司章程，股东不能直接适用公司法来替代外商投资法的相关规定。下面我将详细解释这一结论：

1. 外商投资法的特殊性：

   • 外商投资法是针对外商投资企业的特殊立法，其中包含了诸多针对外商投资企业的特殊规定和保护措施。
   • 这些规定可能与公司法中的一般规定存在差异，因此不能简单地将公司法视为外商投资法的替代。

2. 过渡期的意义：

   • 外商投资法设立5年过渡期，是为了给予外商投资企业足够的时间来调整其经营策略、组织架构和合同条款，以适应新的法律环境。
   • 过渡期内，外商投资企业可以按照原有的规定继续经营，但需要在过渡期内完成必要的调整。

3. 公司章程的重要性：

   • 公司章程是公司的基本法律文件，规定了公司的组织架构、股东权利与义务、经营方式等重要事项。
   • 如果公司章程未根据外商投资法的要求进行修改，那么公司仍然需要遵守原有的公司章程规定，以及外商投资法的相关规定。

4. 股东权利与义务：

   • 股东的权利与义务主要来源于公司章程和法律规定。
   • 在外商投资法过渡期届满后，如果公司章程未进行修改，股东仍然需要按照原有的公司章程和外商投资法的规定来行使权利和履行义务。

5. 法律适用原则：

   • 在法律适用上，特殊法优于一般法。外商投资法作为针对外商投资企业的特殊立法，其规定应当优先于公司法的一般规定。
   • 因此，在外商投资法过渡期届满后，如果公司章程未进行修改，股东不能直接适用公司法来替代外商投资法的相关规定。

综上所述，外商投资法5年过渡期届满后，未修改公司章程的股东不能直接适用公司法。如果股东希望适应新的法律环境，应当积极与公司协商修改公司章程，并确保公司的经营行为符合外商投资法和公司章程的规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。