关于挂靠别人公司做工程并进行进项税抵扣后应缴纳的税点问题，这涉及到多个税种和相应的税率。以下是根据您提供的信息以及一般的税务规定，给出的详细解答：

1. 增值税：

   • 增值税是根据工程款来计算的。具体的税率可能会因工程性质、地区政策等因素有所不同。一般来说，如果提供的是建筑服务，增值税的税率可能是9%（注意，这里的税率可能随时间或政策调整而变化，请以最新税法为准）。
   • 进项税抵扣是指企业在购买商品或接受服务时支付的增值税，可以在销售商品或提供服务时从应纳增值税额中抵扣。因此，实际应缴纳的增值税是销项税减去进项税后的余额。

2. 附加税：

   • 附加税通常是基于增值税的一定比例来计算的。根据您提供的信息，附加税的标准为增值税的12%。但请注意，这个比例也可能因地区或政策而有所不同。

3. 所得税：

   • 所得税是根据所得额来计算的。对于挂靠别人公司做工程的情况，所得额通常是工程收入减去相关成本（包括但不限于材料费、人工费、税费等）后的净利润。
   • 所得税的税率一般为25%，但对于小型微利企业等可能有优惠税率。

4. 印花税：

   • 印花税是根据合同总价的一定比例来计算的。根据您提供的信息，印花税的标准为合同总价的0.03%。

5. 管理费：

   • 管理费一般由双方商定，并没有固定的标准。这通常取决于挂靠公司与被挂靠公司之间的协议。

综上所述，挂靠别人公司做工程并进行进项税抵扣后应缴纳的税点包括增值税、附加税、所得税、印花税以及可能的管理费。具体税额需要根据工程款、成本、税率以及双方协议等多个因素来综合计算。

此外，还需要注意的是，挂靠行为本身可能涉及法律风险，如合同无效、税务违规等。因此，建议在进行挂靠操作前，咨询专业的法律或税务顾问，确保合法合规。同时，也要密切关注税法变化，及时调整税务策略。