关于军队文职人员患有重大疾病是否会被辞退的问题，我可以给出以下明确的回答：
在一般情况下，军队文职人员患有重大疾病，单位在医疗期内不得随意辞退。
这一结论是基于以下法律条款和规定得出的：
法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者患病或非因工负伤，在规定的医疗期内，用人单位不得解除劳动合同。这一规定同样适用于军队文职人员，因为他们在劳动关系上同样受到劳动法的保护。
医疗期保护：医疗期是保障职工因病停止工作治疗休息期间不被解除劳动合同的时限。具体长短由劳动者实际工作年限和在本单位工作年限确定。在医疗期内，军队文职人员享有不被辞退的权益，以确保他们能够得到必要的治疗和休息。
辞退条件：医疗期满后，若军队文职人员既不能从事原工作，又不能从事单位另行安排的工作，用人单位在提前三十日书面通知劳动者本人或者额外支付一个月工资后，可以解除劳动合同。但此时，单位需要向劳动者支付经济补偿。
综上所述，军队文职人员患有重大疾病时，在医疗期内享有不被辞退的权益。医疗期满后，若无法从事原工作或另行安排的工作，单位在履行法定程序后可以解除劳动合同，但需支付经济补偿。
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