不构成约定不明确。下面我来详细解释一下：
在合同中，如果仅约定了补充协议的生效时间，而未约定变更内容的执行时间，这并不一定构成约定不明确。因为补充协议的生效时间与变更内容的执行时间是可以分别独立存在的两个概念。
补充协议的生效时间：这通常指的是补充协议何时开始产生法律效力，即何时对双方当事人产生约束力。一旦补充协议生效，其中所约定的内容（包括变更的内容）就应当被视为合同的一部分，对双方具有法律约束力。
变更内容的执行时间：这指的是变更后的内容何时开始实际履行或执行。这个时间可以与补充协议的生效时间相同，也可以不同。如果合同中没有明确约定变更内容的执行时间，那么通常可以理解为在补充协议生效后，双方应当按照变更后的内容履行，但具体的执行时间可能需要双方进一步协商确定。
因此，仅因为合同中未约定变更内容的执行时间，并不能直接得出约定不明确的结论。在这种情况下，双方可以根据合同的整体内容、交易习惯以及诚信原则等，来合理确定变更内容的执行时间。如果双方无法达成一致，那么可能需要通过法律途径来解决争议。
总之，在合同纠纷中，对于约定是否明确的问题，需要综合考虑合同的整体内容、交易背景以及相关法律法规的规定。如果你在这方面有进一步的疑问或需要具体的法律帮助，请随时向我咨询。