公司对违纪员工作两项以上经济处罚，其合理性需根据具体情况来判断。
首先，从法律角度来看，我国《劳动法》及《劳动合同法》并未明确规定公司不能对违纪员工作两项以上的经济处罚。这意味着，在法律层面上，公司有权根据内部规章制度和员工的违纪情况，决定是否给予多项经济处罚。
然而，合理性并非仅仅由法律条文决定，还需考虑以下几个因素：
公司规章制度：公司应在内部规章制度中明确员工违纪行为的处理方式和处罚标准。如果规章制度中规定了可以对违纪员工作两项以上经济处罚，并且该规定不违反法律法规，那么公司在执行时就是合理的。
处罚的公正性：公司在对员工进行经济处罚时，应确保处罚的公正性。这包括处罚的依据是否充分、处罚的程度是否适当以及处罚的过程是否透明等。如果公司能够确保这些方面的公正性，那么即使对违纪员工作两项以上经济处罚，也是合理的。
员工的权益保护：虽然公司有权对员工进行经济处罚，但也需要考虑员工的权益保护。如果处罚过于严厉或不合理，可能会损害员工的合法权益，引发劳动争议或法律纠纷。因此，公司在制定和执行经济处罚时，应充分考虑员工的权益保护。
综上所述，公司对违纪员工作两项以上经济处罚的合理性需根据具体情况来判断。如果公司能够确保处罚的合法性、公正性和员工的权益保护，那么这样的处罚就是合理的。反之，如果公司在处罚过程中存在违法行为、不公正或损害员工权益的情况，那么这样的处罚就是不合理的。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。