在提出对投标文件的质疑时，应当明确指出涉及的公司投标名称。分析如下：

一. 明确质疑对象

• 根据《中华人民共和国招标投标法》的相关规定，招标过程需要确保公平、公正、公开。当对某个投标文件存在质疑时，为了明确质疑的具体对象，应当在提出质疑时明确指出所涉及的公司投标名称。
• 例如，如果某公司对A公司的投标文件内容存在疑问，那么在提出质疑时，应当明确指出是“对A公司的投标文件提出质疑”。

二. 确保质疑的针对性

• 明确指出公司投标名称有助于招标方、其他投标者以及相关部门快速定位并理解质疑的具体内容，从而确保质疑的针对性和有效性。
• 如果质疑中未提及具体公司投标名称，可能会导致混淆或延误处理，进而影响整个招标流程的进度和公正性。

三. 遵循招标法规

• 按照《中华人民共和国招标投标法》的规定，提出质疑是投标过程中的合法权利，但质疑应当具体、明确，并遵循相关法律法规的程序和要求。
• 明确指出公司投标名称是遵循招标法规、确保质疑合法有效的必要步骤。

综上所述，在提出对投标文件的质疑时，务必明确指出所涉及的公司投标名称，以确保质疑的针对性、有效性和合法性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。