员工离职3年后，公司仍有可能追究其在职期间对公司造成损失的责任，但需考虑仲裁时效和证据充分性。以下是对此问题的详细分析：

1. 考虑仲裁时效：

   • 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。这意味着，如果公司在员工离职后三年内才发现损失或才知道是该员工造成的，那么从发现或应当发现之日起的一年内，公司可以向劳动争议仲裁机构申请仲裁。
   • 如果公司在员工离职后的一年内就已经知道损失并决定追究，但由于某种原因（如协商、调解等）未在一年内提起仲裁，那么后续再提起可能会超过仲裁时效，除非存在中断或中止时效的正当理由。

2. 证据充分性：

   • 公司要追究离职员工的责任，必须提供充分且确凿的证据，证明该员工的特定行为直接导致了公司的损失。这些证据应包括但不限于损失发生的时间、地点、原因、金额以及与员工行为的直接关联性等。
   • 如果证据不足或无法证明损失与员工行为的直接关联性，那么公司即使提起仲裁或诉讼，也可能无法获得支持。

3. 法律依据：

   • 如前所述，《中华人民共和国劳动合同法》第九十条和《中华人民共和国劳动法》第一百零二条均规定了劳动者因违反法律规定或劳动合同约定给公司造成损失时，应承担赔偿责任。
   • 同时，《工资支付暂行规定》第十六条也规定了因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可要求赔偿。

综上所述，员工离职3年后，公司是否能追究其在职期间对公司造成损失的责任，取决于是否超过了仲裁时效以及公司是否能提供充分且确凿的证据。如果两者都满足，那么公司仍有可能通过仲裁或诉讼途径追究员工的责任。我建议公司在发现损失后，及时收集证据并咨询专业律师，以评估追责的可能性和合法性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。