关于“项目停滞，扣留投标保证金2年是否合法”的问题，我首先给出明确的结论：是否合法需根据具体情况及合同约定来判断，不能一概而论。下面我将从几个角度进行详细分析：
合同约定：
- 如果招标文件或合同中明确规定了因项目停滞可以扣留投标保证金，并且扣留期限、条件等也进行了明确约定，那么在这种情况下，扣留投标保证金2年可能是合法的，前提是这些约定不违反相关法律法规的强制性规定。
- 如果合同中没有相关规定，或者规定不明确，那么扣留投标保证金2年就可能缺乏法律依据，从而构成违约或不当得利。
法律法规：
- 根据《中华人民共和国招标投标法》及其实施条例，投标保证金是为了保证投标人按照招标文件的要求参与投标并履行相关义务而设立的。如果投标人没有违反招标文件的规定，那么招标人通常无权随意扣留投标保证金。
- 如果招标人认为投标人存在违约行为，需要扣留投标保证金作为违约金或赔偿，那么应当依据合同约定和法律法规的规定来处理，而不能随意扣留。
实践中的做法：
- 在实践中，如果项目停滞是由于招标人的原因导致的，比如招标流程出现问题、项目资金未到位等，那么招标人通常无权扣留投标保证金。
- 如果项目停滞是由于投标人的原因导致的，比如投标人放弃中标、无法按照合同要求履行义务等，那么招标人可能会根据合同约定扣留投标保证金作为违约金或赔偿。
综上所述，项目停滞时扣留投标保证金2年是否合法，需要根据具体的合同约定、法律法规以及实践中的做法来判断。如果你遇到了这样的情况，建议仔细审查招标文件、合同以及相关法律法规，并咨询专业律师的意见，以维护自己的合法权益。如果你有任何进一步的法律问题，可以直接向我咨询，我专注于处理离婚财产纠纷、合同纠纷以及民间借贷等领域的法律问题。