村干部在立案期间是可以辞职的，但具体是否会被批准，还需根据党组织的决定和实际情况来判断。

首先，从法律角度来看，村干部并非行政机关公务员，因此不适用《行政机关公务员处分条例》中关于立案审查期间不得辞去公职的规定。对于村干部而言，其在立案审查期间辞职的问题，主要需参考党内相关规定。

根据《中国共产党纪律检查机关案件检查工作条例》等党内法规，虽然未明确规定村干部在立案审查期间是否可以辞职，但规定了党组织在特定情况下可以对被调查人采取停职检查等措施。这些规定主要侧重于党组织对被调查人的管理权限，而并未直接禁止被调查人主动辞职。

其次，从实际操作角度来看，村干部在立案期间辞职，可能有利于查清违纪事实真相，因为辞职后，群众可能更敢于作证。同时，辞职也是被审查人主动辞去党内职务的行为，与党组织主动实施的免职行为效果相似。因此，在不影响村委工作正常开展的前提下，党组织可能会考虑批准村干部的辞职申请。

然而，需要注意的是，村干部的辞职申请并非一定会被批准。上级党组织如果认为暂未找到合适替代人选，或者其辞职会影响村委工作的正常开展，也可以不批准其辞职。因此，村干部在立案期间想要辞职，需要充分考虑实际情况，并与党组织进行充分沟通。

综上所述，村干部在立案期间是可以提出辞职申请的，但具体是否会被批准，还需根据党组织的决定和实际情况来判断。如果你有更具体的问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。