一般情况下，不能签订三方协议由分包开具发票给发包方。下面我将从法律实务的角度，详细解释这一结论，并给出相关建议。

核心前提

• 三方协议：涉及发包方、承包方和分包方三方的合同关系。
• 发票开具：通常应由提供服务或销售商品的一方开具给接受服务或商品的一方。

详细解释

1. 合同相对性原则：

   • 根据合同法的相关规定，合同是当事人之间设立、变更、终止民事关系的协议。
   • 在三方协议中，发包方通常与承包方签订主合同，承包方再与分包方签订分包合同。
   • 因此，发票的开具应遵循合同相对性原则，即分包方应开具发票给承包方，承包方再开具发票给发包方。

2. 税收法规要求：

   • 税收法规对发票的开具和管理有严格规定。
   • 分包方直接开具发票给发包方，可能违反税收法规中关于发票开具和纳税申报的规定。
   • 这可能导致税务部门对分包方和发包方进行税务稽查，甚至引发税务风险。

3. 财务和会计管理：

   • 从财务和会计管理的角度来看，分包方直接开具发票给发包方，可能破坏正常的财务和会计秩序。
   • 承包方作为中间环节，需要承担相应的财务管理责任，包括但不限于对分包方的付款、发票管理等。

建议

• 遵循合同相对性原则：在签订三方协议时，应明确各方之间的合同关系，确保发票的开具符合合同相对性原则。
• 加强税收法规学习：了解并遵守税收法规中关于发票开具和纳税申报的规定，避免税务风险。
• 完善财务和会计管理：建立健全的财务和会计管理制度，确保各方之间的财务往来清晰、合规。

综上所述，一般情况下不能签订三方协议由分包开具发票给发包方。如果您在实际操作中遇到具体问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。