建设工程合同纠纷的处理是一个涉及多个步骤和策略的过程，旨在确保双方权益得到公正、高效的维护。以下是对建设工程合同纠纷处理方式的详细阐述：

一、优先协商

协商是解决此类纠纷的首选方式，因其具有成本低、效率高的特点，且有助于维护双方的合作关系。

1. 沟通协商：在纠纷发生后，合同双方应首先尝试通过面对面的沟通来解决问题。双方应坦诚地摆事实、讲道理，共同寻求达成一致的解决方案。
2. 形成书面协议：若协商成功，务必签订书面协议，明确约定解决方案及履行方式、期限等具体内容。这有助于确保双方依约履行，避免后续争议。

二、调解介入

当协商无果时，可寻求第三方调解，以更加灵活和高效的方式解决纠纷。

1. 选择调解机构或人员：可选择具有专业性和公信力的调解机构，如行业协会、专业调解中心等，或双方都信任的个人进行调解。
2. 提出调解申请并提交材料：一方向调解机构或人员提出调解申请，并提交相关纠纷材料，包括合同文本、往来函件、工程资料等，详细说明纠纷背景、争议焦点及期望解决方案。
3. 调解过程与方案：调解机构或人员会组织双方进行调解会议，听取双方陈述，分析争议点，并提出调解方案，促使双方和解。
4. 制作并确认调解协议：若调解成功，应制作调解协议，并经双方签字确认。该协议具有合同效力，双方需按协议履行义务。

三、仲裁裁决（若有仲裁协议）

若合同中约定了仲裁条款，且协商、调解均无果，可通过仲裁方式解决纠纷。

1. 申请仲裁：向约定的仲裁委员会提交仲裁申请书及相关证据材料，明确仲裁请求、事实和理由。
2. 仲裁受理与组成仲裁庭：仲裁委员会审查申请后，若符合受理条件则予以受理，并通知双方。同时，按照仲裁规则组成仲裁庭，成员可由当事人选定或委托仲裁委员会指定。
3. 仲裁审理与裁决：仲裁庭会安排开庭审理，双方需到庭陈述、举证、质证和辩论。仲裁庭根据证据和陈述认定事实，并依据法律法规和合同约定作出裁决。该裁决具有终局性，对双方均有约束力。

四、诉讼解决（若无仲裁协议）

若合同中未约定仲裁条款或双方不愿选择仲裁，可通过诉讼方式解决纠纷。

1. 起诉与立案：一方当事人向有管辖权的人民法院提交起诉状和相关证据材料。法院审查后，若符合立案条件则予以立案，并通知原告缴纳诉讼费。同时，向被告送达起诉状副本、应诉通知书等法律文书。
2. 审理前准备与开庭审理：双方需在规定时间内提交证据，并进行证据交换。法院可能组织庭前会议，梳理争议焦点。随后，按照法定程序开庭审理，包括法庭调查、辩论、当事人最后陈述等环节。
3. 判决与执行：法院根据审理情况作出判决，并向双方送达判决书。若对一审判决不服，可在规定期限内提起上诉，进入二审程序。二审判决为终审判决。若一方不履行判决，另一方可申请强制执行，法院将采取多种执行措施以实现权利。

五、全程注意事项

1. 保留证据：在整个处理流程中，务必妥善保留好相关证据，如合同文件、施工记录、付款凭证等，以支持自己的主张。
2. 了解法律法规：熟悉相关的法律法规和司法解释，确保自身权益得到充分保护。
3. 及时行动：在纠纷发生后，应及时采取行动，避免拖延导致问题复杂化。同时，保持冷静和理性，避免情绪化的处理方式。

综上所述，建设工程合同纠纷的处理方式包括协商、调解、仲裁和诉讼四个主要步骤。在处理过程中，应遵循相应的法律规定和程序要求，以确保纠纷得到公正、高效的解决。同时，双方也应保持沟通和合作的态度，共同寻求最佳的解决方案。