建设工程合同纠纷处理是一个复杂且有序的过程，旨在公正、高效地解决双方之间的争议。以下是详细的纠纷处理流程：
一、初步协商与调解
自行协商：
- 当发生建设工程合同纠纷时，双方应首先尝试通过友好协商的方式解决争议。
- 协商应基于平等、互利的原则，充分沟通，寻求双方都能接受的解决方案。
第三方调解：
- 如果自行协商未能达成一致，双方可以考虑邀请第三方调解机构或专业人士介入调解。
- 调解机构或专业人士将帮助双方更好地理解彼此立场，提出建设性意见，促进争议的和解。
二、仲裁与诉讼
申请仲裁：
- 如果调解未能成功，且合同中明确约定了仲裁条款，双方可以按照约定向指定的仲裁机构申请仲裁。
- 仲裁机构将依据相关法律法规和仲裁规则，对争议进行公正、专业的裁决。
提起诉讼：
- 如果合同中没有约定仲裁条款，或者双方对仲裁结果不满意，可以向有管辖权的人民法院提起诉讼。
- 诉讼过程中，法院将依法对争议进行审理，并作出具有法律效力的判决。
三、专属管辖与法院选择
专属管辖：
- 根据我国法律的规定，建设工程施工合同纠纷属于专属管辖的范围。
- 这意味着当事人不能通过约定来改变纠纷的管辖法院，而应由建设工程所在地的人民法院管辖。
法院选择：
- 在提起诉讼时，应确保选择的法院具有对案件的管辖权。
- 如果合同中有明确的管辖约定，但该约定违反了专属管辖的规定，则该约定无效。
四、无效合同的认定与处理
无效合同的认定：
- 承包人未取得建筑施工企业资质或超越资质等级；
- 没有资质的实际施工人借用资质的建筑施工企业名义；
- 建设工程必须进行招标而未招标或中标无效。
无效合同的处理：
- 立即停止履行；
- 已完工程质量验收合格，发包人应参照无效合同与承包人结算并付款；
- 有过错的应当按照过错进行赔偿，双方都有过错的，按各自过错承担赔偿责任。
五、其他注意事项
- 在整个纠纷处理过程中，双方应保留好相关证据材料，以便在需要时提供证明。
- 遵守法律法规和程序规定，尊重对方的合法权益，避免采取过激或不当行为。
综上所述，建设工程合同纠纷处理流程包括初步协商与调解、仲裁与诉讼、专属管辖与法院选择以及无效合同的认定与处理等环节。双方应依据相关法律法规和程序规定，积极寻求公正、高效的解决方案。