违章建筑被侵害时，一般不可以请求排除妨害。下面我将从法律角度详细解释这一结论：

法律解释

1. 违章建筑的定义：

   • 违章建筑通常指的是未取得建设工程规划许可证或未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的建筑物或构筑物。

2. 排除妨害请求权的基础：

   • 排除妨害请求权是物权人为了保护其物权的圆满状态，对于他人侵害其物权或妨害其物权行使的行为，有权请求排除妨害或消除危险。

3. 违章建筑的物权问题：

   • 由于违章建筑未取得合法的建设手续，因此其并不享有合法的物权。换句话说，违章建筑并不属于法律所保护的“物”的范畴。

4. 法律后果：

   • 既然违章建筑不享有合法的物权，那么当违章建筑被侵害时，其就无法基于物权人的身份请求排除妨害。相反，违章建筑可能会面临被拆除等法律后果。

特殊情况说明

• 在某些特殊情况下，如果违章建筑的建设者能够证明其建筑虽然未取得合法手续，但确实存在某种合理的使用需求或历史遗留问题，并且这种使用并不损害他人或社会的公共利益，那么可能会存在一定的法律救济途径。但这并不意味着可以请求排除妨害，而是需要通过其他法律程序来寻求解决方案。

总结与建议

综上所述，违章建筑被侵害时，一般不可以请求排除妨害。因为违章建筑本身并不享有合法的物权，所以无法基于物权人的身份来主张排除妨害的权利。如果你面临类似的问题，建议咨询当地的法律专业人士或相关部门，以了解具体的法律规定和可能的解决方案。