针对您提出的“司法解释对合同的笔迹鉴定由哪方申请”的问题，这确实是一个涉及合同争议解决过程中的重要环节。以下是对这一问题的详细解答：

首先，我们需要明确的是，在合同争议中，当双方对合同上的笔迹（如签名）真实性产生争议时，笔迹鉴定便成为了一种关键的证据收集手段。这种鉴定能够科学、客观地判断笔迹的真伪，对于解决合同纠纷具有重要意义。

接下来，关于笔迹鉴定的申请方，这主要依据“谁主张，谁举证”的民事诉讼原则，并结合具体的案情来确定。一般来说：

1. 如果用人单位主张劳动者已经签订了合同，而劳动者否认签名是其本人所签：

   • 在这种情况下，由于用人单位是主张合同有效的一方，且合同属于私文书证，因此用人单位需要对合同签名的真实性承担举证责任。如果签名真伪需要通过笔迹鉴定来确认，那么应由用人单位来申请鉴定，并预交鉴定费用。

2. 如果劳动者主张合同上的签名是伪造的，而用人单位坚持认为签名真实：

   • 同样地，由于劳动者是对签名真实性提出质疑的一方，但按照举证责任的原则，仍应由用人单位（作为主张合同有效并用于证明案件事实的一方）来申请笔迹鉴定，以证明其主张的签名真实性。

3. 特殊情况的考虑：

   • 在某些特殊情况下，如果已经有其他证据与合同相互印证，形成了完整的证据链条，足以证明合同签订的事实存在，或者合同签名的真伪对案件裁判结果无实质性影响，那么可能无需启动笔迹鉴定程序。

最后，需要强调的是，笔迹鉴定作为一种专业的证据收集手段，其启动应慎重考虑。在决定申请笔迹鉴定前，双方应充分评估鉴定的必要性、可行性和可能带来的成本负担。同时，在鉴定过程中，双方也应积极配合鉴定机构的工作，提供必要的比对样本和其他相关信息，以确保鉴定结果的准确性和公正性。

综上所述，对于合同笔迹鉴定的申请方，一般应遵循“谁主张，谁举证”的原则，并由主张合同有效并用于证明案件事实的一方（通常是用人单位）来承担举证责任和申请鉴定的义务。