将套房用来做家庭旅馆是否合法，需根据具体情况来判断。以下是对此问题的详细分析：
法律层面：
- 根据相关法律法规，将住宅改变为经营性用房（如家庭旅馆）需要满足一定的条件，并办理相应的手续。例如，可能需要获得相关部门的许可、办理营业执照、符合消防安全要求等。
- 如果未经许可擅自将住宅改为经营性用房，可能会面临法律处罚，如罚款、责令停业等。
小区管理层面：
- 很多小区在物业管理规定或业主公约中，对住宅的用途有明确规定，可能不允许将住宅改为经营性用房。
- 如果违反小区管理规定，可能会受到物业的制止或处罚，甚至引发邻里纠纷。
房屋性质层面：
- 如果套房是租赁来的，那么需要查看租赁合同中是否允许将房屋用于经营性用途。
- 如果房屋是自有产权，也需要考虑房屋的性质（如是否为住宅性质）以及是否允许改变用途。
因此，在决定将套房用来做家庭旅馆之前，建议：
- 咨询相关部门：了解将住宅改为经营性用房需要办理哪些手续，以及是否符合相关规定。
- 查看小区管理规定：确认小区是否允许将住宅改为经营性用房，避免违反规定引发纠纷。
- 检查房屋性质：如果是租赁房屋，查看租赁合同中的相关条款；如果是自有产权，了解房屋的性质及是否允许改变用途。
综上所述，将套房用来做家庭旅馆是否合法，取决于是否满足相关法律法规、小区管理规定以及房屋性质的要求。建议在做出决定前，充分了解并咨询相关专业人士或机构。