批复是可以进行合法性审查的。以下是对这一问题的详细分析：
合法性审查的要点
行政主体资格审查：在审查批复的合法性时，首先要确认作出批复的行政机关是否具备相应的行政主体资格，以及是否在其法定权限范围内实施行政行为。如果行政机关超越其权限范围作出批复，那么该批复在合法性上就会受到质疑。
事实证据审查：行政机关作出批复必须基于充分的事实证据。在审查过程中，需要严格核查行政机关所依据的证据是否真实、可靠、充分，并确保证据与批复之间存在直接的关联性。如果证据不足或证据与批复之间缺乏关联性，那么批复的合法性就会受到影响。
法律法规适用审查：行政机关在作出批复时，必须准确适用相应的法律、法规条款。审查过程中需要检查行政机关是否正确引用了法律条文，是否适用了有效且适用的法律法规。如果法律适用错误或过时，那么批复的合法性同样会受到质疑。
程序合法性审查：行政机关作出批复必须遵循法定的程序。在审查过程中，需要仔细核查行政机关是否按照规定的程序进行操作，如受理、调查、审议、作出决定及送达等。任何程序上的遗漏或违规都将影响批复的合法性。
合理性审查的补充
虽然问题主要询问的是合法性审查，但值得注意的是，在行政复议等行政救济手段中，除了合法性审查外，还会对行政行为的合理性进行审查。这主要是为了确保行政行为的适当性和公正性。因此，在实际操作中，除了关注批复的合法性外，还需要对其合理性进行一定的评估。
综上所述，批复是可以进行合法性审查的，审查过程中需要关注行政主体资格、事实证据、法律法规适用以及程序合法性等方面。如果批复在以上任何一方面存在问题，那么其合法性就会受到质疑。如果你对具体的批复存在疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。