鉴定机构不能自行撤销经过质证的鉴定意见。

一. 鉴定意见的法律地位与重要性

• 鉴定意见在司法审判中具有重要的证据地位，是按照新《民事诉讼法》第63条规定的八大类证据中的一类，有时对认定案件的关键事实起到决定性作用。

二. 鉴定意见的可信度与证明力

• 鉴定意见由具有专业知识、技术、经验的专家提出，具有较高的可信度和证明力。
• 法院对鉴定意见的采信度通常比较高，司法鉴定以其科学性、客观性、权威性、中立性，成为捍卫司法公正的“科学卫士”。

三. 鉴定意见撤回的法理分析

• 鉴定意见是专家在其知识范围内对被鉴定事项的技术分析，一旦作出并被法院查证属实，即取得证据地位。
• 允许鉴定机构任意撤回鉴定意见，可能会造成审判活动失序，影响法院的司法权威。

四. 委托关系的结束与鉴定意见的不可撤销性

• 司法鉴定是法院向鉴定机构出具司法鉴定委托函，鉴定机构出具鉴定意见后，委托行为即结束。
• 委托行为结束后，鉴定机构无权单方撤回其鉴定意见。

五. 对瑕疵鉴定意见的处理

• 对于有瑕疵的鉴定意见，根据最高人民法院《关于民事诉讼证据的若干规定》第27条，可通过补充鉴定、重新质证等方法解决，而非撤销。
• 鉴定机构发现鉴定意见有瑕疵，应立即向委托法院说明，法院则根据案件的具体情况采取相应的应对措施。

六. 法律责任与惩处

• 鉴定机构故意做出错误或虚假鉴定意见，需承担法律责任，包括赔偿责任乃至刑罚惩罚。

综上所述，鉴定机构在出具鉴定意见后，不得自行单方撤回，即使鉴定意见存在瑕疵，也应通过法定程序进行处理，而不是直接撤销。这是为了维护司法审判的严肃性和公正性，保障当事人的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。