针对您提出的“已经入职了但背调不合格有违法记录”的问题，这里给出详细的解答：

首先，明确结论：若您已入职但后续背调发现存在违法记录，用人单位有权根据相关法律法规及合同约定，对您的劳动关系进行相应的处理，包括但不限于解除劳动合同。

接下来，从多个角度分析问题：

1. 背调不合格的原因：

   • 背调中发现的违法记录可能包括但不限于刑事处罚、重大违纪等负面信息。这些信息若与您的岗位职责直接相关，或影响到您作为劳动者的诚信度和可靠性，用人单位可能会认为您不符合录用条件。

2. 企业的处理流程与合法性：

   • 根据《劳动合同法》第八条，用人单位有权了解劳动者与劳动合同直接相关的基本情况，劳动者应当如实说明。若您隐瞒了违法记录，用人单位在背调中发现后，有权依据《劳动合同法》第三十九条的规定，以欺诈手段订立劳动合同为由解除劳动合同，且不支付经济补偿。
   • 企业在处理此类情况时，应确保背调程序的合法性，包括明确告知背调内容及目的、背调内容需与工作直接相关、避免侵犯隐私等。

3. 劳动者的权益保障：

   • 您对背调结果有异议时，可要求复核或提供证明材料。
   • 若认为企业违法解除了劳动合同，您可申请劳动仲裁，要求继续履行合同或支付赔偿金。赔偿金的计算标准通常为每工作满一年支付2个月工资。

4. 争议焦点与司法实践：

   • 试用期解除的合法性边界在于背调结果与岗位职责的关联性。若背调结果与岗位职责无直接关联，或企业未能充分证明背调结果的严重性，解除劳动合同可能被认定为违法。
   • 举证责任方面，企业需要证明背调内容与岗位的关联性及您的主观故意，而您需要证明背调过程存在程序瑕疵或结果不实。

最后，给出建议：

• 对企业：建议在招聘阶段明确告知背调范围及后果，制定清晰的录用条件并写入合同，委托专业第三方机构进行背调以确保程序合规。
• 对求职者：建议如实填写履历，避免因隐瞒导致后续纠纷。若遇到争议，及时咨询律师并保留沟通证据。

综上所述，已入职后背调不合格且有违法记录的情况下，用人单位有权根据相关法律法规及合同约定处理劳动关系。作为劳动者，您应了解自己的权益和可能的法律后果，并在必要时寻求法律援助。