当果园因修路被占用，果树是否可以申请预期收益赔偿，这个问题涉及到土地征收和补偿的相关法律法规。以下是对这一问题的详细解答：

首先，根据相关法律法规，当村里修路占用果树地时，确实会进行补偿。补偿的内容通常包括果树的直接损失以及预期收益的折现。具体来说，补偿会考虑果树的种类、树龄、生长状况、市场价值以及种植成本等因素。对于一些经济价值较高的果树，如苹果树、梨树等，会按照每棵树的市场价值进行补偿，并且还会将预期收益纳入考虑范围。

其次，预期收益折现补偿是果树补偿的重要组成部分。这是因为果树不同于其他普通附着物，它们具有长期的经济产出价值。因此，在补偿时，不仅会考虑果树当前的市场价值，还会对其未来的预期收益进行评估，并将这部分收益折现后纳入补偿金额。

此外，具体的补偿标准和方式可能因地区而异。不同地区可能会根据当地的经济情况、果树种植情况以及政府的相关政策来制定具体的补偿标准。因此，在申请补偿时，建议咨询当地政府部门或专业律师，以了解具体的补偿政策和标准。

最后，需要注意的是，在进行补偿时，相关部门会与果树地的所有者进行协商，确保补偿金额合理、公正，并及时支付补偿款项。如果果园主对补偿金额或补偿方式有异议，可以通过法律途径进行维权。

综上所述，果园因修路被占用时，果树是可以申请预期收益赔偿的。具体的赔偿金额和方式会根据当地的法律法规和政策来确定。建议果园主在申请补偿时，充分了解相关政策，并与相关部门进行积极沟通，以确保自己的合法权益得到保障。