迟到5分钟是否扣全勤奖，这主要取决于公司的具体规章制度。

一般来说，全勤奖是公司为了鼓励员工按时出勤而设立的一种奖励制度。对于迟到是否扣全勤奖，不同公司可能有不同的规定。有的公司可能规定，只要员工迟到，无论迟到多长时间，都会扣除全勤奖；而有的公司则可能规定，只有迟到超过一定时间（如10分钟、15分钟等）才会扣除全勤奖。

因此，要确定迟到5分钟是否扣全勤奖，你需要查阅你所在公司的具体规章制度，或者咨询公司的人力资源部门。如果公司的规章制度中明确规定迟到5分钟会扣除全勤奖，那么你就需要接受这一规定；如果规章制度中没有明确规定，或者规定不明确，你可以与公司的人力资源部门进行沟通，了解公司的具体执行标准。

总之，迟到5分钟是否扣全勤奖，取决于公司的具体规章制度和执行标准。建议你查阅公司的规章制度或咨询人力资源部门，以获取最准确的信息。