京东发票物品与运费分开开是合法的，但前提是必须确保每张发票都符合相关税法规定，且内容真实、准确。以下是对此问题的详细分析：
一. 发票分开开具的合法性
法律依据：
- 根据《中华人民共和国发票管理办法》第二十一条，开具发票应当按照规定的时限、顺序、栏目，全部联次一次性如实开具。这一条款并未明确禁止将物品与运费分开开具发票，但强调了发票内容的真实性和准确性。
合法条件：
- 如果分开开具发票是为了遵守税收法规、准确反映交易情况，并且每一张发票都是基于真实的交易，那么这种行为是合法的。例如，如果销售方不负责运输，而是由购买方自行承担运费，那么购买方可以向运输单位索取运费发票，销售方则开具商品销售发票，这是符合税法规定的。
二. 发票分开开具的合规性要求
内容真实准确：
- 每张发票都必须真实、准确地反映交易情况，不得存在虚开发票的行为。虚开发票是指为他人、为自己开具与实际经营业务情况不符的发票，或者让他人为自己开具与实际经营业务情况不符的发票。
发票管理要求：
- 每张发票都需要加盖发票专用章，且不得重复盖章。税务机关在发票管理中有权进行各项检查，包括查阅、复制与发票有关的凭证、资料等。因此，分开开具的发票应能清晰反映交易的全貌，以备税务机关查验。
三. 实际操作中的考虑
- 在实际操作中，是否将物品与运费分开开具发票，可能还需根据具体的交易情况、客户需求以及企业的财务管理要求来决定。例如，如果客户需要分别核算或报销物品和运费，那么分开开具发票可能更为合适。
我的观点：京东发票物品与运费分开开具是合法的，但前提是必须确保每张发票都符合相关税法规定，且内容真实、准确。在实际操作中，企业和个人应根据具体情况合理开具发票，并遵守税收法规和相关规定。如有进一步需要，您可以继续咨询我。