关于“有质保金的合同是否开全额发票”的问题，我们可以从以下几个方面进行详细解答：

一、质保金的性质

质保金，作为一种履约保证，是合同双方为了确保合同项下的产品或服务质量而约定的一定金额的暂存款项。它并不直接构成销售或服务收入，而是作为一种保证金存在，用于在质保期内对产品或服务的质量问题进行维修或赔偿。

二、发票的开具原则

发票是确认收入并进行税务申报的重要依据。基于发票的开具原则，发票应在发生经营业务并确认营业收入时，由收款方向付款方开具。发票必须包含商品或服务的名称、质量、协议价格等要素，并根据议定条件由购买方向出售方付款。

三、质保金与发票的关系

1. 不属于营业收入：由于质保金并不直接构成销售或服务收入，而是作为一种暂存款项，因此它不属于应纳税范畴，无需开具发票。
2. 开具收据作为凭证：在实际操作中，当收取质保金时，可以开具收据作为收款凭证。收据能够证明收款事实和金额，便于双方进行账务处理和后续核对。

四、特殊情况处理

虽然一般情况下质保金不需要开具发票，但在某些特殊情况下，如合同双方有特别约定或税务部门有特殊要求时，可能需要按照相关规定进行处理。此时，建议咨询专业税务机构或法律顾问以获取准确指导。

五、总结

综上所述，有质保金的合同在收取质保金时，一般不需要开具全额发票。而是可以开具收据作为收款凭证，以证明收款事实和金额。但请注意，在特殊情况下可能需要按照相关规定进行处理，因此建议在实际操作中咨询专业税务机构或法律顾问的意见。