如果包吃包住的厂在员工离职时不退还已缴纳的水电费，员工可以通过法律途径维护自己的权益。以下是对此问题的详细分析：

一. 分析案情与适用法律

1. 合同关系明确：首先，包吃包住的厂与员工之间建立了明确的合同关系，其中包含了水电费的相关约定。若合同中明确规定了离职时水电费的退还政策，员工应依据合同条款主张权利。

2. 财产关系纠纷：若厂方在员工离职时不按约定退还水电费，这实际上构成了一种财产关系纠纷。根据《中华人民共和国民事诉讼法》第三条，人民法院受理公民之间、法人之间、其他组织之间以及他们相互之间因财产关系和人身关系提起的民事诉讼。因此，员工有权向人民法院提起诉讼，要求厂方退还水电费。

二. 具体行动建议

1. 查看合同条款：员工应首先查看与厂方签订的劳动合同或相关协议，明确水电费的缴纳与退还政策。

2. 与厂方协商：在发现水电费未退还后，员工应尝试与厂方进行协商，要求退还相关费用。这一步是解决问题的首选方式，也是最为直接和高效的方法。

3. 提起诉讼：若协商无果，员工可以准备相关证据（如合同、缴费记录、沟通记录等），向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，员工应详细陈述事实，并提供充分的证据支持自己的主张。

三. 总结

综上所述，若包吃包住的厂在员工离职时不退还水电费，员工可以通过查看合同条款、与厂方协商以及提起诉讼等方式来维护自己的权益。我建议员工在采取行动前，先仔细审查合同条款，并尝试与厂方进行友好协商。若协商无果，再考虑通过法律途径解决问题。如有进一步需要，您可以继续咨询我。