孩子在男方不知情的情况下被女方更改户口，这一行为在一般情况下是不合法的。具体分析如下：

一. 一般情况下不合法

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国民法典》第三十五条，监护人应按照最有利于被监护人的原则履行监护职责，除为维护被监护人利益外，不得处分其财产等权益。虽然户口不属于财产，但迁移户口对孩子的生活、教育有重大影响，因此也应遵循此原则，即需经过双方同意。
   • 同时，《中华人民共和国未成年人保护法》第十九条也规定，未成年人的父母或者其他监护人应当根据未成年人的年龄和智力发展状况，在作出与未成年人权益有关的决定前，听取未成年人的意见，并充分考虑其真实意愿。这也间接要求了在涉及孩子户口变动等重大事宜时，应经过父母双方的共同决定。

2. 实践要求：

   • 在实际操作中，公安机关在办理户口迁移时，通常会要求提供父母双方的相关证件和同意手续，以确保户口迁移是经过双方认可的，从而维护未成年人的合法权益。

3. 法律后果：

   • 若女方未经男方同意擅自更改孩子户口，这违反了正常的户口迁移程序和法律规定，可能面临法律责任，包括但不限于恢复户口原状及承担其他相应的法律责任。

二. 特殊情况下可能合法

• 尽管在一般情况下不合法，但也存在一些特殊情况，如女方有充分的证据证明迁移户口是为了孩子的重大利益（如接受更好的教育、医疗资源等），且经过严格的审查和审批程序，或者存在法院判决或调解书等明确要求迁移户口的情况，那么这一行为可能是合法的。

我建议：若您认为自己的权益被侵犯，首先可尝试与女方协商解决。协商无果时，您可咨询律师或通过法律途径解决，如起诉至法院，要求恢复孩子的户口或寻求其他法律救济措施。如有进一步需要，您可以继续咨询我。