针对您提出的“签了施工分包协议但施工方与总包方实际发生了合同关系法律怎么处理”的问题，这里是我的详细解答：

首先，我们需要明确一点：施工分包协议与施工方与总包方实际发生的合同关系之间可能存在不一致或冲突。这种情况下，法律处理会依据实际合同关系的性质、内容以及相关法律法规进行综合判断。

1. 合同关系的认定：

   • 首先，要审查施工分包协议的具体内容，包括协议双方的身份、权利义务、工程范围、价款支付等条款，以确定协议的性质和法律效力。
   • 同时，要考察施工方与总包方实际发生的合同关系，包括双方的实际履行行为、交易习惯、往来函件等，以判断双方是否形成了事实上的合同关系。

2. 法律后果的分析：

   • 如果施工分包协议合法有效，且施工方与总包方实际履行的合同关系与协议内容一致，那么双方应按照协议约定履行各自的权利义务。
   • 如果施工分包协议存在无效或可撤销的情形，或者实际履行的合同关系与协议内容不一致，那么需要根据相关法律法规和司法解释，对合同关系进行重新认定和处理。
     • 例如，如果实际履行的合同关系被认定为事实合同关系，且符合法律规定的要件，那么双方应按照事实合同关系的约定履行权利义务。
     • 如果实际履行的合同关系被认定为无效或可撤销，那么需要根据相关法律法规和司法解释，对无效或可撤销的后果进行处理，如返还财产、赔偿损失等。

3. 法律建议：

   • 在处理此类纠纷时，建议首先通过协商或调解的方式解决，以减少诉讼成本和时间成本。
   • 如果协商或调解无果，可以寻求法律援助或聘请专业律师进行诉讼或仲裁，以维护自身的合法权益。
   • 在诉讼或仲裁过程中，要充分举证证明自己的主张和诉求，包括施工分包协议、实际履行行为的证据等。

综上所述，签了施工分包协议但施工方与总包方实际发生了合同关系时，需要根据实际情况进行法律处理。建议您在处理此类纠纷时，保持冷静和理性，寻求专业法律帮助，以维护自身的合法权益。如果您有任何进一步的问题或需要更具体的法律建议，请随时向我咨询。