如果合同注明汇票付款，一般不可以拒绝接手商业承兑汇票。具体分析如下：

在合同纠纷中，关于付款方式的规定是合同内容的重要组成部分。当合同明确注明采用汇票付款时，这通常意味着双方已就付款方式达成了共识，并且应当按照合同约定的方式进行履行。

商业承兑汇票作为一种合法的支付工具，在符合合同约定的前提下，是可以被接受的。如果合同并未对汇票的具体类型（如银行承兑汇票、商业承兑汇票等）做出明确限制，那么接手商业承兑汇票通常是符合合同约定的。

当然，也存在一些特殊情况。比如，如果合同中有其他条款对汇票的接受做出了特别限制，或者双方在合同之外有其他的口头或书面约定，这些都可能影响对商业承兑汇票的接受。但在没有这些额外限制或约定的情况下，按照合同注明的汇票付款方式，接手商业承兑汇票是合理的。

综上所述，如果合同明确注明汇票付款，且没有额外限制或约定，那么一般不可以拒绝接手商业承兑汇票。如果在实际操作中遇到任何问题或争议，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。