保密协议乙方确实会有一份。保密协议通常是双方或多方之间签订的，旨在保护特定信息不被泄露，对各方均设定了相应义务。以下是对此结论的详细阐述：

1. 协议双方各持一份：

   • 保密协议一般会让双方各持一份，这样做的目的在于让双方都能清楚协议里的各项内容，包括各自的权利、义务等。
   • 从证据方面来讲，双方各自持有一份协议，当出现争议时，能够拿出原始的协议文本作为有力依据。

2. 电子形式签订的有效性：

   • 若双方是通过电子形式签订保密协议，并且有可靠的电子存证方法，即使其中一方没有纸质副本，这份协议依旧是有效的。

3. 签订后的注意事项：

   • 签订保密协议后，双方应严格遵守保密范围，明确哪些信息属于保密内容，不得擅自扩大或缩小。
   • 双方各自持有协议，也便于随时查阅协议条款，监督对方是否切实履行保密义务。

4. 法律角度的认可：

   • 从法律角度看，保密协议属于合同的一种形式要求。双方各持一份协议文本，能确保双方都清楚知晓各自的权利义务。
   • 若发生纠纷进入司法程序，法院也会认可双方各执一份协议为有效且合理的做法，以此为基础进行事实认定和法律适用。

综上所述，保密协议乙方确实会有一份，这是为了保障双方权益、明确各自义务，并确保在争议发生时能够有据可依。如果您在保密协议方面有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。