涉密项目合同通常确实会包含保密协议。下面我将从几个方面详细解释这一点：

1. 保密协议的定义与目的：

   • 保密协议，也称为保密条款或保密约定，是合同当事人之间就合同项下涉及的商业秘密、技术秘密、经营信息等敏感信息，约定不得向第三方披露、使用或允许他人使用的协议。
   • 在涉密项目合同中，由于项目本身涉及商业秘密、技术秘密等敏感信息，为了保护这些信息不被泄露，合同双方通常会签订保密协议。

2. 保密协议的内容：

   • 保密协议通常会明确保密信息的范围、保密期限、保密措施、保密责任以及违约后的法律责任等内容。
   • 具体来说，保密信息可能包括但不限于技术资料、客户名单、经营策略、财务数据等。保密期限则可能根据项目的性质、商业秘密的重要性等因素来确定。保密措施则可能包括物理隔离、加密存储、访问控制等。

3. 保密协议的法律效力：

   • 保密协议一旦签订，即具有法律效力。如果合同一方违反了保密协议，可能会面临法律上的责任，包括但不限于赔偿损失、承担违约责任等。
   • 因此，在签订涉密项目合同时，双方都应认真对待保密协议的签订和履行，以确保商业秘密等敏感信息得到有效保护。

4. 实际案例：

   • 在实际商业活动中，涉密项目合同中的保密协议是非常常见的。例如，在研发合作、技术转让、产品销售等合同中，都可能会包含保密协议。
   • 这些保密协议的存在，不仅有助于保护合同双方的商业秘密等敏感信息，也有助于维护商业活动的公平性和诚信原则。

综上所述，涉密项目合同通常确实会包含保密协议，这是为了保护合同双方的商业秘密等敏感信息不被泄露。如果你在具体合同中遇到了相关问题或疑虑，可以随时向我咨询，我会为你提供专业的法律建议和支持。