扣考勤款不告知直接扣现金，造成个税纠纷，属于克扣工资的行为。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 克扣工资的定义

克扣工资是指用人单位无正当理由扣减劳动者应得工资的行为。根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。因此，任何非经劳动者同意且无法律依据的工资扣减，均可视为克扣工资。

二. 扣考勤款不告知直接扣现金的行为分析

1. 未告知即扣款：如果用人单位在未告知员工的情况下直接扣除了考勤款，这违反了劳动法规中关于工资支付应当公开、透明的原则。员工有权知悉工资的具体构成及扣款原因。

2. 直接扣现金：工资应当以货币形式按月支付给劳动者，直接扣现金可能涉及未经劳动者同意擅自改变工资支付方式的问题，这同样可能构成违法。

三. 个税纠纷与克扣工资的关系

虽然个税纠纷通常涉及税务问题，但如果用人单位以扣税为名，实则克扣员工工资，那么这种行为同样构成克扣工资。例如，如果用人单位无端扣除个税，且未能提供合理的扣税理由和凭证，这实际上是对员工工资的非法扣减。

四. 处理建议

1. 与用人单位沟通：首先，员工可以尝试与用人单位沟通，了解扣款原因和依据。如果发现是误解或误操作造成的，可以要求用人单位及时退还扣款。

2. 向劳动行政部门举报：如果沟通无果，员工可以向当地劳动行政部门举报，要求用人单位支付被克扣的工资，并可能获得相应的经济补偿。

3. 申请劳动仲裁或提起诉讼：如果劳动行政部门的处理未能满足员工的合理诉求，员工还可以向当地劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，或向法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。

综上所述，扣考勤款不告知直接扣现金，造成个税纠纷，属于克扣工资的行为。员工有权依法维护自己的合法权益，并可以通过与用人单位沟通、向劳动行政部门举报以及申请劳动仲裁或提起诉讼等方式来寻求解决。

我建议您尽快采取行动，与用人单位沟通并保留相关证据，以便在必要时维护自己的权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。