甲方扣水电费是否需要开发票以及是否合法，取决于具体的情况和双方的合同约定。以下是对此问题的详细分析：

一. 是否需要开发票

1. 若施工方转售水电给甲方：

   • 施工方在施工现场单独安装水表、电表，并自行采购后转售给甲方使用。根据税法规定，这种转售行为属于增值税应税行为，施工方需向甲方开具增值税发票。

2. 若甲方统一支付水电费并代扣施工方部分：

   • 情况一：甲方取得的水电费发票包含施工方应承担的部分。此时，甲方无需向施工方开具发票，但应提供供水、供电部门开具的发票复印件及水电费分割单，作为企业所得税税前扣除凭证。
   • 情况二：甲方的水电费发票仅为自身使用部分，施工方的水电费独立计量且由甲方代扣。在这种情况下，施工方应向甲方开具发票，因为这相当于施工方向甲方提供了水电服务。

二. 是否合法

• 根据《中华人民共和国发票管理办法》第十九条，所有单位和从事生产、经营活动的个人在购买商品、接受服务以及从事其他经营活动支付款项时，应当向收款方取得发票。因此，无论是甲方还是施工方，在涉及水电费支付时，都应依法开具或索取发票，以确保交易的合法性和合规性。

三. 总结与建议

• 双方应在合同中明确约定水电费的承担方式、发票开具要求及相关税务处理，以避免纠纷和税务风险。
• 无论合同如何约定，双方都必须遵守国家税法规定，确保发票的合规性。
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