农村自建房安全鉴定由当地建设行政主管部门规定。以下是对此问题的详细分析：
一. 法律依据与部门职责
法律依据：
- 根据《中华人民共和国建筑法》的相关规定，建筑工程安全生产管理、建筑工程设计以及建筑施工企业的施工组织设计，均强调了工程安全的重要性，并规定了相应的安全技术措施和责任制度。虽然该法并未直接提及农村自建房安全鉴定的具体部门，但它为建筑安全提供了总的法律框架。
部门职责：
- 在实际操作中，农村自建房的安全鉴定工作通常由当地建设行政主管部门负责。这些部门包括但不限于村镇规划建设管理办公室、乡镇（街道办事处）、县建设局、市质监站等相关机构。这些部门根据国家和地方的相关法律法规，以及技术标准，对农村自建房进行安全鉴定，以确保房屋的安全性能。
二. 安全鉴定流程与要求
流程：
- 农村自建房安全鉴定通常包括初始调查、现场检测、分析验算、评级定性等多个环节。鉴定机构会根据房屋的实际情况，结合相关技术标准，对房屋的安全性进行全面评估。
要求：
- 进行农村自建房安全鉴定的机构需要具备相应的资质和能力，确保鉴定结果的准确性和可靠性。同时，鉴定过程需要遵循客观公正、真实准确、科学可靠的工作原则。
三. 实际操作中的建议
- 在进行农村自建房安全鉴定时，建议联系当地的建筑工程质量监督部门或相关建设行政主管部门，了解具体的鉴定流程和要求。
- 可以选择委托具有资质的房屋安全鉴定机构进行鉴定，并确保鉴定过程符合相关法律法规和技术标准。
我的观点：农村自建房安全鉴定是确保房屋安全性能的重要环节，应当由当地建设行政主管部门负责并规定具体的鉴定流程和要求。在实际操作中，建议遵循相关法律法规和技术标准，选择具有资质的鉴定机构进行鉴定，以确保鉴定结果的准确性和可靠性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。