挂靠公司账号被查封后，经过法院起诉挂靠公司和发包方，使工程款付给实际施工人的流程，主要包括提出执行异议、协商处理、提起诉讼等步骤。具体分析如下：

一. 提出执行异议

实际施工人（挂靠人）可以在执行法院下发扣划通知后立即提出执行异议。如果执行异议不能得到法院的支持，可继续提起执行异议之诉。根据最高院的相关裁定，若挂靠人能够证明其是案涉工程的实际施工人，且被挂靠人并未对案涉工程施工进行技术、质量方面的管理，也没有对案涉工程进行过投资，那么挂靠人有权提出执行异议，阻止工程款被作为被挂靠人的债权被强制执行。

• 例如，挂靠人可以提供相关工程资料、建材资料、验收资料以及向第三方付款凭证等证据，证明其实际参与了案涉工程的施工。

二. 与发包人协商

在挂靠关系中，工程项目事实上的承包人与实际权利义务承受者是挂靠人。因此，挂靠人可以与发包人协商，重新招投标另行选择被挂靠公司承揽工程。针对已施工部分，挂靠人可以与重新招投标承揽项目的被挂靠人共同结算。

• 例如，挂靠人可以与发包人沟通，说明被挂靠人账户被冻结的情况，并提议重新招投标，以确保工程项目的顺利进行。同时，挂靠人应与新的被挂靠人协商好共同结算的方式和细节。

三. 提起诉讼

如果协商无果，挂靠人可以直接起诉发包人与被挂靠人，要求发包人直接向挂靠人支付工程款。根据《中华人民共和国民法典》第七百九十三条第一款的规定，建设工程施工合同无效，但建设工程经验收合格的，可以参照合同关于工程价款的约定折价补偿承包人。在挂靠人与发包人之间形成事实上的建设工程施工合同关系且建设工程经验收合格的情况下，挂靠人有权请求发包人参照合同关于工程价款的约定折价补偿。

• 例如，挂靠人可以向法院提起诉讼，请求确认其与发包人之间的事实建设工程施工合同关系，并要求发包人按照合同约定支付工程款。同时，挂靠人也可以请求法院确认被挂靠人账户中的工程款归其所有，并排除对该款项的执行。

我建议在实际操作中，挂靠人应充分收集证据，证明其是案涉工程的实际施工人，并尽快与发包人协商或提起诉讼，以维护自己的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。